Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB15P59190 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB15P59190 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB15P59190 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB15P59190 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB15P59190 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB15P59190 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB15P59190 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB15P59190 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB15P59190 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB15P59190 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB15P59190 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB15P59190 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB15P59190 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB15P59190 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB15P59190 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB15P59190 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB15P59190 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB15P59190 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB15P59190 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB15P59190 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB15P59190 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB15P59190 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB15P59190 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB15P59190 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB15P59190 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB15P59190 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB15P59190 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB15P59190 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB15P59190 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB15P59190 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB15P59190 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB15P59190 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB15P59190 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB15P59190 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB15P59190 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB15P59190 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB15P59190 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB15P59190 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB15P59190 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB15P59190 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB15P59190 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB15P59190 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB15P59190 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB15P59190 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB15P59190 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB15P59190 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB15P59190 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB15P59190 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB15P59190 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB15P59190 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB15P59190 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB15P59190 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB15P59190 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB15P59190 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB15P59190 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB15P59190 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB15P59190 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB15P59190 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB15P59190 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB15P59190 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB15P59190 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB15P59190 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB15P59190 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB15P59190 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB15P59190 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB15P59190 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB15P59190 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB15P59190 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB15P59190 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB15P59190 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB15P59190 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB15P59190 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB15P59190 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB15P59190 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB15P59190 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB15P59190 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB15P59190 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB15P59190 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB15P59190 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB15P59190 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms