Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp1P59054 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Csrnp1P59054 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csrnp1P59054 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp1P59054 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp1P59054 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Csrnp1P59054 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp1P59054 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms