Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM3BP58499 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3BP58499 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3BP58499 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FAM3BP58499 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms