Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C21orf59P57076 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C21orf59P57076 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C21orf59P57076 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C21orf59P57076 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C21orf59P57076 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C21orf59P57076 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms