Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIK1P57059 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIK1P57059 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIK1P57059 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIK1P57059 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIK1P57059 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIK1P57059 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIK1P57059 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIK1P57059 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIK1P57059 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SIK1P57059 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIK1P57059 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIK1P57059 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIK1P57059 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIK1P57059 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIK1P57059 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIK1P57059 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIK1P57059 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIK1P57059 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIK1P57059 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIK1P57059 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIK1P57059 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
SIK1P57059 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SIK1P57059 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SIK1P57059 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SIK1P57059 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SIK1P57059 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SIK1P57059 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIK1P57059 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIK1P57059 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SIK1P57059 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SIK1P57059 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SIK1P57059 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SIK1P57059 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SIK1P57059 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SIK1P57059 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIK1P57059 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIK1P57059 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIK1P57059 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIK1P57059 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIK1P57059 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIK1P57059 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIK1P57059 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIK1P57059 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIK1P57059 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIK1P57059 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SIK1P57059 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIK1P57059 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SIK1P57059 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIK1P57059 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIK1P57059 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIK1P57059 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIK1P57059 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIK1P57059 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIK1P57059 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIK1P57059 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIK1P57059 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIK1P57059 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIK1P57059 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIK1P57059 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIK1P57059 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIK1P57059 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIK1P57059 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIK1P57059 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIK1P57059 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIK1P57059 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIK1P57059 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SIK1P57059 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIK1P57059 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIK1P57059 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SIK1P57059 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SIK1P57059 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIK1P57059 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIK1P57059 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIK1P57059 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIK1P57059 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIK1P57059 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIK1P57059 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SIK1P57059 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIK1P57059 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIK1P57059 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIK1P57059 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIK1P57059 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIK1P57059 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIK1P57059 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIK1P57059 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIK1P57059 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SIK1P57059 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SIK1P57059 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIK1P57059 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIK1P57059 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SIK1P57059 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIK1P57059 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIK1P57059 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIK1P57059 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIK1P57059 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIK1P57059 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIK1P57059 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIK1P57059 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SIK1P57059 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms