Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lim2P56563 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lim2P56563 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lim2P56563 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lim2P56563 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lim2P56563 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lim2P56563 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lim2P56563 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lim2P56563 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lim2P56563 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lim2P56563 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lim2P56563 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lim2P56563 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lim2P56563 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lim2P56563 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lim2P56563 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lim2P56563 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lim2P56563 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lim2P56563 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lim2P56563 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms