Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CckbrP56481 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CckbrP56481 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CckbrP56481 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CckbrP56481 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CckbrP56481 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CckbrP56481 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CckbrP56481 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CckbrP56481 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CckbrP56481 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CckbrP56481 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CckbrP56481 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CckbrP56481 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckbrP56481 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckbrP56481 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CckbrP56481 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CckbrP56481 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CckbrP56481 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CckbrP56481 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms