Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irf5P56477 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irf5P56477 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Irf5P56477 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf5P56477 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irf5P56477 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irf5P56477 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irf5P56477 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irf5P56477 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irf5P56477 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irf5P56477 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irf5P56477 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irf5P56477 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irf5P56477 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Irf5P56477 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irf5P56477 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irf5P56477 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irf5P56477 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irf5P56477 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irf5P56477 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms