Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAG2P55895 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAG2P55895 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAG2P55895 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAG2P55895 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAG2P55895 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAG2P55895 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAG2P55895 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAG2P55895 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAG2P55895 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAG2P55895 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAG2P55895 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAG2P55895 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAG2P55895 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAG2P55895 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAG2P55895 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAG2P55895 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAG2P55895 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAG2P55895 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAG2P55895 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAG2P55895 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAG2P55895 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAG2P55895 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAG2P55895 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAG2P55895 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAG2P55895 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAG2P55895 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAG2P55895 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAG2P55895 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAG2P55895 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAG2P55895 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAG2P55895 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAG2P55895 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAG2P55895 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAG2P55895 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAG2P55895 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAG2P55895 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAG2P55895 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAG2P55895 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAG2P55895 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAG2P55895 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAG2P55895 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAG2P55895 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAG2P55895 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAG2P55895 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAG2P55895 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAG2P55895 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAG2P55895 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAG2P55895 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAG2P55895 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAG2P55895 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAG2P55895 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAG2P55895 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAG2P55895 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAG2P55895 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAG2P55895 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAG2P55895 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAG2P55895 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAG2P55895 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAG2P55895 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAG2P55895 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAG2P55895 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAG2P55895 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAG2P55895 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAG2P55895 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAG2P55895 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAG2P55895 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAG2P55895 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAG2P55895 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAG2P55895 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAG2P55895 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAG2P55895 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAG2P55895 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAG2P55895 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAG2P55895 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAG2P55895 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAG2P55895 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAG2P55895 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAG2P55895 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAG2P55895 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAG2P55895 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAG2P55895 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAG2P55895 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAG2P55895 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAG2P55895 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAG2P55895 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms