Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BGRP55822 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BGRP55822 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BGRP55822 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BGRP55822 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BGRP55822 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms