Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CASP7P55210 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CASP7P55210 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CASP7P55210 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CASP7P55210 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASP7P55210 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASP7P55210 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP7P55210 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP7P55210 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP7P55210 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP7P55210 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CASP7P55210 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CASP7P55210 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CASP7P55210 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP7P55210 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP7P55210 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP7P55210 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP7P55210 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASP7P55210 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CASP7P55210 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CASP7P55210 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CASP7P55210 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CASP7P55210 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CASP7P55210 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CASP7P55210 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CASP7P55210 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CASP7P55210 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CASP7P55210 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CASP7P55210 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CASP7P55210 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CASP7P55210 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CASP7P55210 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CASP7P55210 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CASP7P55210 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CASP7P55210 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CASP7P55210 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CASP7P55210 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CASP7P55210 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CASP7P55210 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CASP7P55210 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CASP7P55210 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CASP7P55210 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASP7P55210 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASP7P55210 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CASP7P55210 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CASP7P55210 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CASP7P55210 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP7P55210 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP7P55210 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CASP7P55210 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CASP7P55210 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASP7P55210 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASP7P55210 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CASP7P55210 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASP7P55210 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASP7P55210 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASP7P55210 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASP7P55210 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CASP7P55210 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASP7P55210 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASP7P55210 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASP7P55210 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASP7P55210 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASP7P55210 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP7P55210 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP7P55210 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP7P55210 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP7P55210 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASP7P55210 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASP7P55210 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASP7P55210 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CASP7P55210 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CASP7P55210 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CASP7P55210 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CASP7P55210 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASP7P55210 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASP7P55210 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASP7P55210 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CASP7P55210 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CASP7P55210 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CASP7P55210 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CASP7P55210 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms