Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PltpP55065 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PltpP55065 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PltpP55065 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PltpP55065 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PltpP55065 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PltpP55065 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PltpP55065 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PltpP55065 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PltpP55065 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PltpP55065 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PltpP55065 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PltpP55065 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PltpP55065 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PltpP55065 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PltpP55065 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PltpP55065 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PltpP55065 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PltpP55065 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PltpP55065 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PltpP55065 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PltpP55065 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PltpP55065 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PltpP55065 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PltpP55065 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PltpP55065 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PltpP55065 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PltpP55065 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PltpP55065 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PltpP55065 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PltpP55065 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PltpP55065 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PltpP55065 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PltpP55065 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PltpP55065 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PltpP55065 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PltpP55065 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PltpP55065 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PltpP55065 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PltpP55065 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PltpP55065 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PltpP55065 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PltpP55065 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PltpP55065 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PltpP55065 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PltpP55065 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PltpP55065 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PltpP55065 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PltpP55065 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PltpP55065 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PltpP55065 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PltpP55065 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PltpP55065 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PltpP55065 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PltpP55065 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PltpP55065 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PltpP55065 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PltpP55065 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PltpP55065 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PltpP55065 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PltpP55065 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PltpP55065 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PltpP55065 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PltpP55065 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PltpP55065 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PltpP55065 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PltpP55065 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PltpP55065 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PltpP55065 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PltpP55065 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PltpP55065 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PltpP55065 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PltpP55065 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PltpP55065 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PltpP55065 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PltpP55065 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PltpP55065 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PltpP55065 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PltpP55065 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PltpP55065 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PltpP55065 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PltpP55065 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PltpP55065 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PltpP55065 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms