Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMP1P54849 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMP1P54849 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EMP1P54849 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMP1P54849 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMP1P54849 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMP1P54849 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMP1P54849 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMP1P54849 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMP1P54849 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMP1P54849 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMP1P54849 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMP1P54849 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMP1P54849 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMP1P54849 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMP1P54849 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMP1P54849 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMP1P54849 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMP1P54849 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMP1P54849 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMP1P54849 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMP1P54849 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMP1P54849 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMP1P54849 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMP1P54849 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMP1P54849 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMP1P54849 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMP1P54849 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMP1P54849 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EMP1P54849 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EMP1P54849 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EMP1P54849 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EMP1P54849 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EMP1P54849 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EMP1P54849 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EMP1P54849 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EMP1P54849 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EMP1P54849 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EMP1P54849 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMP1P54849 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMP1P54849 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMP1P54849 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMP1P54849 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMP1P54849 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMP1P54849 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMP1P54849 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMP1P54849 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMP1P54849 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EMP1P54849 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EMP1P54849 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EMP1P54849 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EMP1P54849 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EMP1P54849 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EMP1P54849 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EMP1P54849 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EMP1P54849 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EMP1P54849 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EMP1P54849 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EMP1P54849 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EMP1P54849 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EMP1P54849 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms