Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GYS2P54840 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GYS2P54840 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GYS2P54840 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GYS2P54840 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GYS2P54840 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GYS2P54840 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GYS2P54840 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GYS2P54840 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYS2P54840 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYS2P54840 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYS2P54840 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GYS2P54840 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GYS2P54840 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GYS2P54840 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GYS2P54840 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GYS2P54840 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GYS2P54840 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GYS2P54840 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GYS2P54840 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GYS2P54840 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GYS2P54840 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GYS2P54840 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GYS2P54840 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GYS2P54840 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GYS2P54840 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GYS2P54840 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GYS2P54840 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GYS2P54840 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GYS2P54840 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GYS2P54840 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GYS2P54840 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GYS2P54840 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GYS2P54840 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GYS2P54840 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GYS2P54840 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GYS2P54840 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GYS2P54840 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GYS2P54840 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GYS2P54840 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GYS2P54840 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GYS2P54840 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GYS2P54840 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GYS2P54840 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GYS2P54840 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GYS2P54840 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GYS2P54840 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GYS2P54840 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GYS2P54840 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GYS2P54840 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GYS2P54840 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GYS2P54840 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GYS2P54840 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GYS2P54840 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GYS2P54840 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GYS2P54840 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GYS2P54840 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GYS2P54840 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GYS2P54840 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GYS2P54840 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GYS2P54840 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GYS2P54840 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GYS2P54840 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GYS2P54840 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GYS2P54840 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GYS2P54840 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GYS2P54840 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GYS2P54840 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GYS2P54840 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GYS2P54840 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GYS2P54840 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GYS2P54840 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GYS2P54840 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GYS2P54840 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GYS2P54840 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GYS2P54840 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GYS2P54840 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GYS2P54840 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYS2P54840 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms