Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P54278 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMS2P54278 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PMS2P54278 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMS2P54278 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS2P54278 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PMS2P54278 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS2P54278 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS2P54278 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS2P54278 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS2P54278 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMS2P54278 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS2P54278 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS2P54278 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS2P54278 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS2P54278 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS2P54278 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS2P54278 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P54278 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P54278 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P54278 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P54278 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS2P54278 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS2P54278 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS2P54278 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS2P54278 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PMS2P54278 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P54278 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P54278 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P54278 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P54278 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS2P54278 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS2P54278 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS2P54278 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS2P54278 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS2P54278 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS2P54278 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS2P54278 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS2P54278 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS2P54278 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS2P54278 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS2P54278 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMS2P54278 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMS2P54278 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS2P54278 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMS2P54278 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P54278 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P54278 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P54278 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMS2P54278 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS2P54278 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS2P54278 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS2P54278 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS2P54278 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS2P54278 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMS2P54278 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS2P54278 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS2P54278 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS2P54278 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PMS2P54278 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS2P54278 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS2P54278 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PMS2P54278 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS2P54278 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS2P54278 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PMS2P54278 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS2P54278 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS2P54278 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS2P54278 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PMS2P54278 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PMS2P54278 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS2P54278 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PMS2P54278 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P54278 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P54278 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P54278 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P54278 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PMS2P54278 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PMS2P54278 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS2P54278 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS2P54278 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS2P54278 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PMS2P54278 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS2P54278 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS2P54278 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS2P54278 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PMS2P54278 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 804.6 ms