Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP1P54107 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRISP1P54107 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRISP1P54107 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRISP1P54107 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms