Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A3P53794 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A3P53794 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A3P53794 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A3P53794 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A3P53794 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A3P53794 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A3P53794 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A3P53794 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A3P53794 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A3P53794 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms