Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRYBA4P53673 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA4P53673 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBA4P53673 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms