Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-5P52952 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX2-5P52952 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-5P52952 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX2-5P52952 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-5P52952 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms