Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP98P52948 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP98P52948 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NUP98P52948 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP98P52948 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP98P52948 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NUP98P52948 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NUP98P52948 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NUP98P52948 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NUP98P52948 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP98P52948 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP98P52948 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NUP98P52948 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP98P52948 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NUP98P52948 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NUP98P52948 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP98P52948 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP98P52948 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NUP98P52948 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP98P52948 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP98P52948 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP98P52948 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP98P52948 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP98P52948 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP98P52948 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP98P52948 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP98P52948 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP98P52948 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP98P52948 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP98P52948 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP98P52948 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP98P52948 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP98P52948 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP98P52948 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP98P52948 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP98P52948 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP98P52948 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP98P52948 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP98P52948 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP98P52948 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP98P52948 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP98P52948 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP98P52948 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP98P52948 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP98P52948 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP98P52948 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP98P52948 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NUP98P52948 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NUP98P52948 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP98P52948 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP98P52948 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP98P52948 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUP98P52948 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUP98P52948 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUP98P52948 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUP98P52948 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUP98P52948 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP98P52948 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NUP98P52948 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUP98P52948 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUP98P52948 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUP98P52948 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP98P52948 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUP98P52948 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUP98P52948 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP98P52948 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUP98P52948 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP98P52948 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NUP98P52948 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP98P52948 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP98P52948 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NUP98P52948 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP98P52948 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP98P52948 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP98P52948 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP98P52948 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP98P52948 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP98P52948 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NUP98P52948 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP98P52948 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP98P52948 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP98P52948 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUP98P52948 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUP98P52948 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NUP98P52948 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUP98P52948 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUP98P52948 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NUP98P52948 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUP98P52948 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms