Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GTF2A2P52657 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GTF2A2P52657 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2A2P52657 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2A2P52657 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GTF2A2P52657 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GTF2A2P52657 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2A2P52657 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF2A2P52657 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTF2A2P52657 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GTF2A2P52657 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF2A2P52657 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms