Protein–RNA interactions for Protein: P52594

AGFG1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGFG1P52594 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGFG1P52594 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGFG1P52594 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGFG1P52594 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGFG1P52594 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGFG1P52594 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms