Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2JP52435 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2JP52435 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2JP52435 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms