Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR8P51685 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR8P51685 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR8P51685 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR8P51685 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR8P51685 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR8P51685 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR8P51685 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR8P51685 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR8P51685 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR8P51685 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR8P51685 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR8P51685 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR8P51685 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR8P51685 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR8P51685 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR8P51685 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCR8P51685 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR8P51685 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR8P51685 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR8P51685 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR8P51685 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR8P51685 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR8P51685 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR8P51685 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR8P51685 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR8P51685 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR8P51685 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR8P51685 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR8P51685 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR8P51685 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR8P51685 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR8P51685 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR8P51685 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR8P51685 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR8P51685 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR8P51685 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR8P51685 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR8P51685 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR8P51685 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR8P51685 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR8P51685 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR8P51685 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR8P51685 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR8P51685 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR8P51685 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR8P51685 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR8P51685 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR8P51685 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR8P51685 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR8P51685 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCR8P51685 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCR8P51685 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR8P51685 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR8P51685 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR8P51685 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR8P51685 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR8P51685 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR8P51685 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR8P51685 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR8P51685 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR8P51685 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR8P51685 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR8P51685 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR8P51685 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR8P51685 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR8P51685 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR8P51685 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR8P51685 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR8P51685 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR8P51685 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR8P51685 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR8P51685 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR8P51685 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR8P51685 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR8P51685 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR8P51685 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR8P51685 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR8P51685 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR8P51685 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR8P51685 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms