Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCR5P51681 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCR5P51681 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCR5P51681 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCR5P51681 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCR5P51681 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCR5P51681 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCR5P51681 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCR5P51681 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCR5P51681 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCR5P51681 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCR5P51681 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCR5P51681 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCR5P51681 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCR5P51681 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCR5P51681 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCR5P51681 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCR5P51681 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCR5P51681 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCR5P51681 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCR5P51681 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCR5P51681 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCR5P51681 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCR5P51681 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCR5P51681 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCR5P51681 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCR5P51681 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCR5P51681 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCR5P51681 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CCR5P51681 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCR5P51681 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCR5P51681 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCR5P51681 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCR5P51681 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCR5P51681 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCR5P51681 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCR5P51681 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCR5P51681 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCR5P51681 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR5P51681 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR5P51681 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR5P51681 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCR5P51681 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCR5P51681 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR5P51681 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR5P51681 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR5P51681 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR5P51681 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR5P51681 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR5P51681 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR5P51681 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR5P51681 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR5P51681 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR5P51681 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCR5P51681 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCR5P51681 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCR5P51681 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCR5P51681 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR5P51681 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR5P51681 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR5P51681 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR5P51681 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR5P51681 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR5P51681 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR5P51681 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR5P51681 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR5P51681 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCR5P51681 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR5P51681 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR5P51681 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR5P51681 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR5P51681 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR5P51681 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR5P51681 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR5P51681 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR5P51681 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR5P51681 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR5P51681 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR5P51681 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR5P51681 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR5P51681 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCR5P51681 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR5P51681 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms