Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR4P51679 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCR4P51679 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCR4P51679 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR4P51679 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR4P51679 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR4P51679 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR4P51679 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR4P51679 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR4P51679 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR4P51679 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR4P51679 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR4P51679 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR4P51679 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR4P51679 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR4P51679 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR4P51679 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR4P51679 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR4P51679 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR4P51679 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCR4P51679 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR4P51679 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR4P51679 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR4P51679 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR4P51679 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR4P51679 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR4P51679 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR4P51679 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR4P51679 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR4P51679 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR4P51679 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR4P51679 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR4P51679 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR4P51679 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR4P51679 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR4P51679 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCR4P51679 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR4P51679 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR4P51679 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR4P51679 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR4P51679 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR4P51679 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR4P51679 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR4P51679 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR4P51679 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR4P51679 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR4P51679 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR4P51679 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR4P51679 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR4P51679 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR4P51679 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR4P51679 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR4P51679 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR4P51679 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR4P51679 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR4P51679 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR4P51679 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR4P51679 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR4P51679 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR4P51679 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR4P51679 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR4P51679 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR4P51679 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR4P51679 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR4P51679 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR4P51679 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR4P51679 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR4P51679 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR4P51679 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR4P51679 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR4P51679 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR4P51679 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR4P51679 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR4P51679 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR4P51679 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR4P51679 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR4P51679 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR4P51679 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR4P51679 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR4P51679 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR4P51679 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR4P51679 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR4P51679 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR4P51679 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR4P51679 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR4P51679 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR4P51679 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms