Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1P51610 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCFC1P51610 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1P51610 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HCFC1P51610 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCFC1P51610 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms