Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNA2P51530 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNA2P51530 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNA2P51530 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNA2P51530 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNA2P51530 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNA2P51530 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNA2P51530 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNA2P51530 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNA2P51530 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNA2P51530 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNA2P51530 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNA2P51530 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNA2P51530 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNA2P51530 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNA2P51530 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DNA2P51530 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNA2P51530 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNA2P51530 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNA2P51530 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DNA2P51530 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNA2P51530 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNA2P51530 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DNA2P51530 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DNA2P51530 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNA2P51530 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNA2P51530 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNA2P51530 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNA2P51530 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNA2P51530 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNA2P51530 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNA2P51530 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNA2P51530 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNA2P51530 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNA2P51530 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNA2P51530 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNA2P51530 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNA2P51530 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNA2P51530 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNA2P51530 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNA2P51530 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNA2P51530 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNA2P51530 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DNA2P51530 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNA2P51530 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNA2P51530 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNA2P51530 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNA2P51530 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNA2P51530 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNA2P51530 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNA2P51530 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNA2P51530 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DNA2P51530 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNA2P51530 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNA2P51530 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNA2P51530 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNA2P51530 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DNA2P51530 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNA2P51530 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNA2P51530 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNA2P51530 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNA2P51530 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNA2P51530 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNA2P51530 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNA2P51530 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNA2P51530 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNA2P51530 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNA2P51530 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DNA2P51530 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNA2P51530 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNA2P51530 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNA2P51530 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DNA2P51530 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNA2P51530 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNA2P51530 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNA2P51530 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNA2P51530 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNA2P51530 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNA2P51530 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DNA2P51530 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNA2P51530 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNA2P51530 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNA2P51530 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNA2P51530 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNA2P51530 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNA2P51530 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNA2P51530 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNA2P51530 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms