Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa6P50704 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa6P50704 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa6P50704 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa6P50704 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa6P50704 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa6P50704 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa6P50704 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa6P50704 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa6P50704 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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