Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MRE11P49959 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MRE11P49959 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MRE11P49959 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MRE11P49959 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MRE11P49959 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRE11P49959 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MRE11P49959 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRE11P49959 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRE11P49959 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MRE11P49959 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MRE11P49959 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRE11P49959 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRE11P49959 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRE11P49959 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRE11P49959 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRE11P49959 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRE11P49959 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRE11P49959 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRE11P49959 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRE11P49959 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MRE11P49959 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRE11P49959 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRE11P49959 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRE11P49959 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRE11P49959 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRE11P49959 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MRE11P49959 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRE11P49959 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRE11P49959 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRE11P49959 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MRE11P49959 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRE11P49959 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRE11P49959 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRE11P49959 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRE11P49959 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRE11P49959 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRE11P49959 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MRE11P49959 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MRE11P49959 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MRE11P49959 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MRE11P49959 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRE11P49959 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRE11P49959 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRE11P49959 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRE11P49959 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRE11P49959 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MRE11P49959 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MRE11P49959 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MRE11P49959 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MRE11P49959 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRE11P49959 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRE11P49959 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRE11P49959 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRE11P49959 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MRE11P49959 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRE11P49959 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRE11P49959 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRE11P49959 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRE11P49959 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MRE11P49959 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRE11P49959 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRE11P49959 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRE11P49959 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRE11P49959 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRE11P49959 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRE11P49959 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRE11P49959 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRE11P49959 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRE11P49959 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRE11P49959 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRE11P49959 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRE11P49959 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRE11P49959 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MRE11P49959 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRE11P49959 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRE11P49959 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRE11P49959 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms