Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3AP49840 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSK3AP49840 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSK3AP49840 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3AP49840 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSK3AP49840 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms