Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psen1P49769 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psen1P49769 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psen1P49769 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psen1P49769 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen1P49769 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen1P49769 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen1P49769 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen1P49769 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen1P49769 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen1P49769 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen1P49769 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psen1P49769 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psen1P49769 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psen1P49769 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psen1P49769 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms