Protein–RNA interactions for Protein: P49718

Mcm5, DNA replication licensing factor MCM5, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm5P49718 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mcm5P49718 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mcm5P49718 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mcm5P49718 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mcm5P49718 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mcm5P49718 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mcm5P49718 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mcm5P49718 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mcm5P49718 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mcm5P49718 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mcm5P49718 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mcm5P49718 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mcm5P49718 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mcm5P49718 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mcm5P49718 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcm5P49718 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcm5P49718 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcm5P49718 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Mcm5P49718 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcm5P49718 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms