Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPAP49450 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPAP49450 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPAP49450 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPAP49450 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPAP49450 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPAP49450 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPAP49450 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPAP49450 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPAP49450 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPAP49450 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPAP49450 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPAP49450 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPAP49450 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPAP49450 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPAP49450 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPAP49450 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPAP49450 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPAP49450 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPAP49450 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPAP49450 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPAP49450 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPAP49450 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPAP49450 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPAP49450 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPAP49450 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPAP49450 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPAP49450 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPAP49450 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPAP49450 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPAP49450 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPAP49450 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPAP49450 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPAP49450 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPAP49450 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPAP49450 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPAP49450 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPAP49450 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPAP49450 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPAP49450 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPAP49450 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPAP49450 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPAP49450 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPAP49450 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPAP49450 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPAP49450 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPAP49450 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPAP49450 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPAP49450 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPAP49450 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPAP49450 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPAP49450 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPAP49450 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPAP49450 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPAP49450 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPAP49450 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPAP49450 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPAP49450 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPAP49450 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPAP49450 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPAP49450 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPAP49450 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPAP49450 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPAP49450 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPAP49450 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPAP49450 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPAP49450 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPAP49450 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPAP49450 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPAP49450 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPAP49450 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPAP49450 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms