Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A6P48664 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A6P48664 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A6P48664 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A6P48664 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms