Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REG1BP48304 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REG1BP48304 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REG1BP48304 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REG1BP48304 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REG1BP48304 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REG1BP48304 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
REG1BP48304 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REG1BP48304 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REG1BP48304 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REG1BP48304 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REG1BP48304 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
REG1BP48304 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REG1BP48304 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REG1BP48304 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REG1BP48304 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REG1BP48304 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REG1BP48304 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REG1BP48304 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REG1BP48304 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REG1BP48304 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
REG1BP48304 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REG1BP48304 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REG1BP48304 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
REG1BP48304 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REG1BP48304 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REG1BP48304 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REG1BP48304 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REG1BP48304 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REG1BP48304 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REG1BP48304 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
REG1BP48304 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REG1BP48304 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
REG1BP48304 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REG1BP48304 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REG1BP48304 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REG1BP48304 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REG1BP48304 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REG1BP48304 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REG1BP48304 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REG1BP48304 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REG1BP48304 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REG1BP48304 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REG1BP48304 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REG1BP48304 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
REG1BP48304 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REG1BP48304 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REG1BP48304 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REG1BP48304 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REG1BP48304 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
REG1BP48304 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REG1BP48304 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REG1BP48304 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REG1BP48304 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
REG1BP48304 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REG1BP48304 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REG1BP48304 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REG1BP48304 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REG1BP48304 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REG1BP48304 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REG1BP48304 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REG1BP48304 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REG1BP48304 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REG1BP48304 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REG1BP48304 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REG1BP48304 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REG1BP48304 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REG1BP48304 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
REG1BP48304 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
REG1BP48304 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
REG1BP48304 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
REG1BP48304 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
REG1BP48304 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
REG1BP48304 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
REG1BP48304 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
REG1BP48304 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
REG1BP48304 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
REG1BP48304 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
REG1BP48304 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
REG1BP48304 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
REG1BP48304 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
REG1BP48304 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
REG1BP48304 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
REG1BP48304 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
REG1BP48304 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms