Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALDH1A3P47895 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALDH1A3P47895 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALDH1A3P47895 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALDH1A3P47895 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ALDH1A3P47895 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A3P47895 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms