Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
IQGAP1P46940 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
IQGAP1P46940 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
IQGAP1P46940 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
IQGAP1P46940 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
IQGAP1P46940 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
IQGAP1P46940 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IQGAP1P46940 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms