Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nedd4P46935 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nedd4P46935 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nedd4P46935 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nedd4P46935 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Nedd4P46935 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nedd4P46935 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nedd4P46935 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nedd4P46935 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nedd4P46935 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nedd4P46935 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nedd4P46935 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nedd4P46935 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nedd4P46935 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nedd4P46935 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms