Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPL21P46778 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL21P46778 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL21P46778 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL21P46778 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL21P46778 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPL21P46778 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL21P46778 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL21P46778 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPL21P46778 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL21P46778 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL21P46778 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL21P46778 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL21P46778 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL21P46778 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL21P46778 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL21P46778 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPL21P46778 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPL21P46778 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPL21P46778 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL21P46778 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL21P46778 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL21P46778 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL21P46778 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPL21P46778 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL21P46778 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL21P46778 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL21P46778 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL21P46778 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPL21P46778 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL21P46778 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL21P46778 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL21P46778 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL21P46778 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL21P46778 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL21P46778 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL21P46778 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL21P46778 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL21P46778 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL21P46778 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPL21P46778 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL21P46778 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL21P46778 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL21P46778 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL21P46778 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL21P46778 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL21P46778 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL21P46778 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL21P46778 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL21P46778 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL21P46778 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPL21P46778 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL21P46778 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL21P46778 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL21P46778 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL21P46778 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPL21P46778 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL21P46778 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL21P46778 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPL21P46778 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RPL21P46778 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RPL21P46778 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL21P46778 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL21P46778 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL21P46778 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL21P46778 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL21P46778 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL21P46778 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL21P46778 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL21P46778 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPL21P46778 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL21P46778 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL21P46778 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL21P46778 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL21P46778 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL21P46778 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL21P46778 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL21P46778 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL21P46778 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL21P46778 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL21P46778 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPL21P46778 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL21P46778 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL21P46778 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL21P46778 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL21P46778 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL21P46778 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL21P46778 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL21P46778 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL21P46778 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL21P46778 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL21P46778 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL21P46778 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL21P46778 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL21P46778 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL21P46778 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL21P46778 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPL21P46778 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms