Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4bP46467 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4bP46467 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps4bP46467 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps4bP46467 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps4bP46467 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms