Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCG1P45844 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCG1P45844 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCG1P45844 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCG1P45844 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG1P45844 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms