Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN9P43378 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN9P43378 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN9P43378 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN9P43378 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN9P43378 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN9P43378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN9P43378 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN9P43378 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN9P43378 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPN9P43378 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms