Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A3P43003 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A3P43003 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A3P43003 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A3P43003 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms