Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTR1BP42025 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTR1BP42025 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTR1BP42025 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTR1BP42025 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTR1BP42025 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms