Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ELK3P41970 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ELK3P41970 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ELK3P41970 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ELK3P41970 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ELK3P41970 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ELK3P41970 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ELK3P41970 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ELK3P41970 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ELK3P41970 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ELK3P41970 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ELK3P41970 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ELK3P41970 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ELK3P41970 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ELK3P41970 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ELK3P41970 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ELK3P41970 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ELK3P41970 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ELK3P41970 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ELK3P41970 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ELK3P41970 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ELK3P41970 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ELK3P41970 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ELK3P41970 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ELK3P41970 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ELK3P41970 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ELK3P41970 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ELK3P41970 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ELK3P41970 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ELK3P41970 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELK3P41970 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELK3P41970 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELK3P41970 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELK3P41970 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELK3P41970 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ELK3P41970 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELK3P41970 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELK3P41970 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELK3P41970 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELK3P41970 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELK3P41970 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELK3P41970 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELK3P41970 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELK3P41970 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELK3P41970 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELK3P41970 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELK3P41970 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELK3P41970 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELK3P41970 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ELK3P41970 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELK3P41970 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELK3P41970 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELK3P41970 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELK3P41970 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ELK3P41970 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ELK3P41970 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ELK3P41970 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ELK3P41970 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ELK3P41970 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ELK3P41970 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ELK3P41970 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ELK3P41970 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ELK3P41970 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ELK3P41970 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ELK3P41970 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ELK3P41970 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELK3P41970 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELK3P41970 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELK3P41970 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ELK3P41970 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELK3P41970 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELK3P41970 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELK3P41970 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ELK3P41970 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ELK3P41970 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELK3P41970 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELK3P41970 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ELK3P41970 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ELK3P41970 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ELK3P41970 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ELK3P41970 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELK3P41970 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ELK3P41970 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELK3P41970 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELK3P41970 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELK3P41970 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELK3P41970 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ELK3P41970 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms