Protein–RNA interactions for Protein: P41217

CD200, OX-2 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD200P41217 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD200P41217 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD200P41217 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD200P41217 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD200P41217 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD200P41217 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD200P41217 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD200P41217 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD200P41217 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD200P41217 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD200P41217 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD200P41217 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD200P41217 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD200P41217 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD200P41217 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD200P41217 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD200P41217 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD200P41217 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD200P41217 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD200P41217 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD200P41217 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD200P41217 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD200P41217 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD200P41217 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD200P41217 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD200P41217 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD200P41217 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD200P41217 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD200P41217 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD200P41217 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD200P41217 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD200P41217 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD200P41217 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD200P41217 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD200P41217 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD200P41217 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD200P41217 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CD200P41217 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD200P41217 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD200P41217 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD200P41217 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD200P41217 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD200P41217 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD200P41217 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD200P41217 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD200P41217 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD200P41217 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD200P41217 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD200P41217 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD200P41217 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD200P41217 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD200P41217 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD200P41217 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD200P41217 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD200P41217 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD200P41217 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD200P41217 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD200P41217 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD200P41217 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD200P41217 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD200P41217 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD200P41217 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD200P41217 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD200P41217 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD200P41217 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD200P41217 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD200P41217 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD200P41217 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD200P41217 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD200P41217 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD200P41217 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD200P41217 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD200P41217 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD200P41217 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD200P41217 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD200P41217 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD200P41217 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms