Protein–RNA interactions for Protein: P40889

YJL225C, Y' element ATP-dependent helicase YJL225C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL225CP40889 DLD3YEL071W 1491 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL225CP40889 YOR268CYOR268C 399 nt10.77□□□□□ -0.68
YJL225CP40889 LSP1YPL004C 1026 nt10.77□□□□□ -0.68
YJL225CP40889 EDC2YER035W 438 nt10.75□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 HRA1HRA1 564 nt10.75□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 SRP54YPR088C 1626 nt10.74□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 YMR166CYMR166C 1107 nt10.73□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 TOS1YBR162C 1368 nt10.73□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 ENT4YLL038C 744 nt10.72□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 ILV3YJR016C 1758 nt10.72□□□□□ -0.69
YJL225CP40889 CRC1YOR100C 984 nt10.7□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 HAP5YOR358W 729 nt10.7□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 MRS6YOR370C 1812 nt10.69□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 ADE1YAR015W 921 nt10.69□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 YMR265CYMR265C 1386 nt10.68□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 BAP3YDR046C 1815 nt10.67□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 INA1YLR413W 2028 nt10.66□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 PRE5YMR314W 705 nt10.65□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 KEL3YPL263C 1956 nt10.65□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 GID8YMR135C 1368 nt10.65□□□□□ -0.7
YJL225CP40889 YPL247CYPL247C 1572 nt10.65□□□□□ -0.71
YJL225CP40889 SAN1YDR143C 1833 nt10.64□□□□□ -0.71
YJL225CP40889 RIM2YBR192W 1134 nt10.64□□□□□ -0.71
YJL225CP40889 ARO8YGL202W 1503 nt10.62□□□□□ -0.71
YJL225CP40889 YKL133CYKL133C 1392 nt10.61□□□□□ -0.71
YJL225CP40889 PTC6YCR079W 1329 nt10.59□□□□□ -0.71
YJL225CP40889 YHR219WYHR219W 1875 nt10.58□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 SNX3YOR357C 489 nt10.57□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 MRP1YDR347W 966 nt10.56□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 COQ8YGL119W 1506 nt10.56□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 KES1YPL145C 1305 nt10.55□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 KGD2YDR148C 1392 nt10.55□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 FUS3YBL016W 1062 nt10.54□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 YPT11YNL304W 1254 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 SDH8YBR269C 417 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL225CP40889 YER156CYER156C 1017 nt10.52□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 BXI1YNL305C 894 nt10.52□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 snR31snR31 225 nt10.52□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 GDH1YOR375C 1365 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 NCA3YJL116C 1014 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 MET22YOL064C 1074 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 RPS6AYPL090C 711 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 RPS6BYBR181C 711 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 NUP53YMR153W 1428 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL225CP40889 SHC1YER096W 1539 nt10.46□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 MUP1YGR055W 1725 nt10.45□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 SPT20YOL148C 1815 nt10.45□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 HAC1YFL031W 717 nt10.44□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 YJL043WYJL043W 774 nt10.44□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 HOL1YNR055C 1761 nt10.44□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 RPN14YGL004C 1254 nt10.44□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 GAS1YMR307W 1680 nt10.43□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 YIL168WYIL168W 384 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 TDH1YJL052W 999 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 ZAP1YJL056C 2643 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 YLR358CYLR358C 564 nt10.42□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 SGA1YIL099W 1650 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 OCH1YGL038C 1443 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 THI3YDL080C 1830 nt10.4□□□□□ -0.74
YJL225CP40889 SBP1YHL034C 885 nt10.39□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 TAD2YJL035C 753 nt10.39□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 MFT1YML062C 1179 nt10.39□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 UGP1YKL035W 1500 nt10.38□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 PET494YNR045W 1470 nt10.37□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 YFR020WYFR020W 699 nt10.37□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 CAK1YFL029C 1107 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL225CP40889 SSL2YIL143C 2532 nt10.33□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 CHS7YHR142W 951 nt10.33□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 RRT6YGL146C 936 nt10.32□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 APT1YML022W 564 nt10.32□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 RPD3YNL330C 1302 nt10.31□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 YPR084WYPR084W 1371 nt10.31□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 RSM7YJR113C 744 nt10.3□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 RNA170RNA170 169 nt10.29□□□□□ -0.76
YJL225CP40889 RRT14YIL127C 621 nt10.27□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 RPC31YNL151C 756 nt10.27□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 GPM1YKL152C 744 nt10.25□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 AAC3YBR085W 924 nt10.25□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 PDC6YGR087C 1692 nt10.25□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 ODC1YPL134C 933 nt10.24□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 RHO1YPR165W 630 nt10.24□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 CWP2YKL096W-A 279 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 UME6YDR207C 2511 nt10.22□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 YLR460CYLR460C 1131 nt10.21□□□□□ -0.77
YJL225CP40889 GGA2YHR108W 1758 nt10.2□□□□□ -0.78
YJL225CP40889 DPL1YDR294C 1770 nt10.19□□□□□ -0.78
YJL225CP40889 COS10YNR075W 1125 nt10.18□□□□□ -0.78
YJL225CP40889 PUP3YER094C 618 nt10.17□□□□□ -0.78
YJL225CP40889 SPR1YOR190W 1338 nt10.17□□□□□ -0.78
YJL225CP40889 YPT31YER031C 672 nt10.15□□□□□ -0.78
YJL225CP40889 PIH1YHR034C 1035 nt10.14□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 CYS3YAL012W 1185 nt10.14□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 YML079WYML079W 606 nt10.13□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 TMS1YDR105C 1422 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 THI73YLR004C 1572 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 CMP2YML057W 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 MEP1YGR121C 1479 nt10.1□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 HXT8YJL214W 1710 nt10.1□□□□□ -0.79
YJL225CP40889 ESBP6YNL125C 2022 nt10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms