Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAP2P40123 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CAP2P40123 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CAP2P40123 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CAP2P40123 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP2P40123 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP2P40123 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP2P40123 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP2P40123 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP2P40123 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CAP2P40123 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CAP2P40123 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAP2P40123 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAP2P40123 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CAP2P40123 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAP2P40123 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAP2P40123 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAP2P40123 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAP2P40123 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAP2P40123 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAP2P40123 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAP2P40123 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CAP2P40123 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CAP2P40123 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAP2P40123 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAP2P40123 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAP2P40123 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAP2P40123 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAP2P40123 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAP2P40123 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAP2P40123 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAP2P40123 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAP2P40123 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAP2P40123 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAP2P40123 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAP2P40123 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAP2P40123 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAP2P40123 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAP2P40123 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAP2P40123 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CAP2P40123 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAP2P40123 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAP2P40123 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAP2P40123 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CAP2P40123 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAP2P40123 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAP2P40123 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAP2P40123 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAP2P40123 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAP2P40123 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAP2P40123 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAP2P40123 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAP2P40123 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAP2P40123 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CAP2P40123 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAP2P40123 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAP2P40123 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAP2P40123 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAP2P40123 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAP2P40123 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAP2P40123 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CAP2P40123 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAP2P40123 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAP2P40123 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAP2P40123 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAP2P40123 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CAP2P40123 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAP2P40123 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAP2P40123 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAP2P40123 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAP2P40123 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAP2P40123 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAP2P40123 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAP2P40123 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAP2P40123 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAP2P40123 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CAP2P40123 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAP2P40123 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAP2P40123 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAP2P40123 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAP2P40123 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAP2P40123 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAP2P40123 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAP2P40123 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAP2P40123 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CAP2P40123 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAP2P40123 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAP2P40123 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAP2P40123 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAP2P40123 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms