Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
IGHMBP2P38935 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IGHMBP2P38935 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
IGHMBP2P38935 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
IGHMBP2P38935 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IGHMBP2P38935 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
IGHMBP2P38935 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
IGHMBP2P38935 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGHMBP2P38935 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGHMBP2P38935 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGHMBP2P38935 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IGHMBP2P38935 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
IGHMBP2P38935 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
IGHMBP2P38935 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms